"Preurediti" antitijela može kontrolirati virus humane imunodeficijencije

Uz pomoć kompjuterski program pod nazivom "Rosetta", istraživači sa Univerziteta Vanderbilt "rekonstruiran" antitijela koja je povećala svoju aktivnost i bio u mogućnosti da neutrališe veća sojeva virusa humane imunodeficijencije (HIV) od bilo kog poznatog prirodnog antitijela.

Njihova otkrića, koji je objavljen 18. maj 2015 na web stranici časopisa Journal of Clinical Investigation, ukazuju na to da obrađena na računaru antitijela može ubrzati potragu za efikasnih tretmana ili vakcine protiv virusa, koji je do sada izmicao svim pokušajima da ga uništi.

"Postoji konsenzus (HIV), koji je radni vakcina će se razvijati", - rekao je James Crowe, MD, direktor Vanderbilt vakcine centar, koji je vodio posao, zajedno sa Jens Mailer, docent hemije i farmakologije.

Rad sa kolegama iz Instituta istraživanje Scripps u La Jolla, California, istraživači sa Univerziteta Vanderbilt započeo "roditelja" od antitijela, krv izoliran zaraženih HIV-om osobe, koja je imala jak "neutraliziranje" efekat HIV-a u laboratorijskim testovima.

Rosetta, naučnici su koristili kompjuterski program koji može predvidjeti strukturu proteina iz sekvence aminokiselina, za "reorganizacija" antitijela. Mijenjanje jedne aminokiseline su u mogućnosti da se poboljša stabilnost antitijela kada je povezan sa koverta proteina HIV-a.

Istraživači nisu promijenili interfejs između antitijela i virusa. Najvjerojatnije, povećanjem termodinamičke stabilnosti, antitijela postao čvršći i postao bolji fit proteina HIV-a (kao ključem).

"Promjenom jedne aminokiseline, jesmo to četiri puta jači od četiri puta jači, a počelo konzumiranje više HIV-sojeva od roditelja antitijela," - kaže dr Crow, profesor pedijatrije i patologije, mikrobiologije i imunologije.

Original, izolovanom antitijela se trenutno proizvodi u velikom broju jednog klona imunih ćelija, kao "monoklonskih" antitijela. Ona je sada u fazi kliničkih ispitivanja. Dr. Crowe rekao preuređenu antitijela mogu biti dodan u studiju kao verzija druge generacije.

Obim preurediti antitijela brzo razvijala zbog potrebe za liječenje i prevenciju iscrpljuju i često fatalne virusnih infekcija, kao i za tehnološki napredak omogućili su da "vidi" i za poboljšanje interakcije između virusa i antitijela, uništavajući ga.

HIV - podmukao neprijatelj. Da biste izbjegli otkrivanje od strane imunološkog sistema, svaki dan se razvija ili mijenja proteina na njihovoj površini. Jedan od HIV-pozitivnih osoba ima više varijanti virusa od svih sojeva gripe izoliran u svijetu. Imuni sistem jednostavno ne mogu držati korak s njima.

U 2013. godini, naučnici iz Instituta istraživanje Scripps predvodi Ian Wilson, dr, i Andrew Ward, Ph.D., opisano u časopisu Science, struktura koverte proteina HIV-a, koristeći kristalografije i krio-elektronskim mikroskopom. "Sada znamo kako to izgleda - rekao je dr Crowe. - Ne možemo bolje razumjeti kako da se cilj u njega ".

Prošle godine, Dr. Crowe i drugi kolega iz Instituta istraživanje Scripps, William Schiff, Ph.D., iskazani u časopisu Nature da "računarski dizajn protein" se može koristiti za stvaranje moćne neutralizaciju antitijela protiv respiratornog sincicijalni virus (RSV), vodeći uzrok respiratorne infekcije u novorođenčadi.

"To je bio prvi članak u kojem ljudi složili da je kompjuter dizajn vakcine radi", - rekao je dr Crowe.

Naučnici sada koriste kompjuter za stvaranje neutralizaciju antitijela protiv HIV-dijelova kovertu protein, koji se ne mijenja.

Dr. Crow vjeruje da će, ako računarski dizajn može predvidjeti kako će se virus razvijati u budućnosti, potencijalno mogu razviti antitijela i vakcine protiv virusa prije bilo kakve promjene u stvari.

U tom cilju, Dr. Crowe i dr Mailer u organizaciji Interface Group - širok saradnje naučnika, uključujući i eksperte u teoriji igara koje simuliraju interakcije između virusa i imuni sistem.